Der Verbandsvorstand entscheidet über die laufenden Angelegenheiten des Verbandes. Zentrale Aufgabe ist es, Beschlüsse der Verbandsversammlung vorzubereiten und diese auszuführen. Er entspricht in seinen Aufgaben einem Gemeindevorstand bzw. Magistrat in den hessischen Kommunen. 

Mitglieder des Verbandsvorstandes sind nach der Satzung des Verbandes die Bürgermeister der drei Mitgliedskommunen sowie die Landräte der Kreise Werra-Meißner und Hersfeld-Rotenburg. Für die konkrete Umsetzung seiner Beschlüsse bedient sich der Vorstand einer Geschäftsführerin. Diese Funktion nimmt Frau Ermisch-Knabe von der Stadtverwaltung Sontra wahr.

Der Verbandsvorstand tagt in der Regel einmal monatlich in einer nichtöffentlichen Sitzung.  

Verbansvorstand
Karl-Heinz Schäfer, Verbandsvorsitzender, Bürgermeister Sontra
Ralf Hilmes, stellvertr. Verbandsvorsitzender, Bürgermeister Nentershausen
Helmut Schmidt, Bürgermeister Herleshausen
Stefan Reuß, Landrat Werra-Meißner-Kreis
Dr. Karl-Ernst Schmidt, Landrat Landkreis Hersfeld-Rotenburg

Schriftführer Timo Friedrich, Mitarbeiter der Gemeinde Nentershausen

Oberstes Organ des Zweckverbandes ist die Verbandsversammlung. Sie entscheidet über alle wichtigen Angelegenheiten des Verbandes und die ihr durch Gesetz und die Verbandssatzung zugewiesenen Aufgaben. Sie ist insbesondere zuständig für den Erlass, die Änderung und Aufhebung von Satzungen inklusive der Verbandssatzung und sonstigen Rechtsnormen sowie den Erlass der Haushaltssatzung und der Nachträge.

Die Verbandsversammlung des InKomZ hat zur Zeit insgesamt 16 Mitglieder, die von den Mitgliedskommunen, dem Werra-Meißner-Kreis sowie dem Landkreis Hersfeld-Rotenburg in die Versammlung entsandt werden.